Vilniaus universiteto Filosofijos fakulteto bendruomenė aktyviai dalyvauja nacionalinių ir tarptautinių programų projektų inicijavime ir įgyvendinime. Metų eigoje vidutiniškai yra vykdoma apie 70–80 įvairių projektų – iš nacionalinių dažniausiai dalyvaujama:
• Lietuvos mokslo tarybos finansuojamuose – mokslininkų grupių, nacionalinių programų („Modernybė Lietuvoje“, „Gerovės visuomenė“, „Valstybė ir tauta: paveldas ir tapatumas“, „Socialiniai iššūkiai nacionaliniam saugumui“, „Lituanistikos plėtros programa“, „Valstybinė lituanistinių tyrimų ir sklaidos 2016–2024 metų programa”, „Atviros partnerystės projektai“).
• Lietuvos mokslo tarybos / ES Struktūrinių fondų finansuojamuose („Visuotinė dotacija“, „Podoktorantūros stažuotės“, „Mokslinės išvykos ir stažuotės“, „Studentų moksliniai tyrimai ir praktika“).
• Lietuvos kultūros tarybos – humanitarinės literatūros leidybos ir kultūros tyrimų projektai.
• ES Struktūrinių fondų projektuose.
Tarptautinius mokslo ir studijų srities projektus Filosofijos fakulteto mokslininkai kartu su užsienio partneriais įgyvendina dalyvaujant šių programų projektuose:
• ES programa Horizontas 2020;
• Erasmus+ programa;
• COST;
• NORDPLUS programa;
• Europos Komisijos direktoratų finansuojamos programos.